其中，蒙古三人，汉人六人，汉化契丹人一人，汉化畏兀儿人一人，回回一人，说明忽必烈比较注意联合各族上层分子，特别注意联台汉族地主阶级。
宰执下面设有众多僚佐，主要有参议中书省事、郎中、员外郎、都事等。中书省下设吏部、户部、礼部、兵部、刑部、工部六部，各部最高长官都称尚书。负责各方面具体工作。
枢密院于中统四年(1263)正式设置，掌管天下兵甲机密之务，与中书省分掌行政和军事大权。
枢密院最高长官为枢密使，例由皇太子兼任，未立皇太子时空缺。实际长官为枢密副使、佥书枢密院事，后来又在枢密副使之上设知枢密院事(简称知院)、同知枢密院事(简称同知),在佥书枢密院事之下设同佥书枢密院事、院判等，名额不定。
御史台正式设于至元五年(1268),是中央的最高监察机构。长官有御史大夫、御史中丞、侍御史、治书侍御史等。
忽必烈所设置的枢密院和御史台虽与中书省并称，可以自行奏事、自选僚属，分别对皇帝负责，但在文书往来上仍然显示出与中书省地位的差别。
中书省发送枢密院、御史台的文书，行文使用由上行下的“札”;而枢密院和御史台发送中书省的文书，行文则使用由下行上的“呈”。