在这种东西方同时流行大瘟疫的背景下，宗教开始奠定了在人类史上的地位。
与乱世之中太平道和后来的道教趁机崛起一样，宗教倡导的对于病人和灾民的人文关怀和彼此的互助精神，对于身处乱世和瘟疫横行地区的人民来说，是一种具有巨大吸引力的存在。
正是基于互助和关怀精神，基督教尽管一开始被罗马帝国官方视为邪教进行镇压，但仍然在瘟疫横行的罗马帝国境内如火如荼地传播开了。而张角的太平道在东汉末年也正是如此。汉末三国之后，中国又进入了魏晋南北朝大乱世，在这场为时近400年（184—581年）的大乱世中，佛教和玄学均在中国崛起。
对于身处乱世、经历战乱、饥荒、瘟疫横行，对前景几乎完全看不到希望的乱世人民来说，佛教所倡导的对于来生的美好向往，以及佛教寺院所进行的人文关怀和尽管极有限度的赈灾救济，是乱世之中具有巨大吸引力的存在，最终，佛教在汉末三国和魏晋南北朝的大乱世中，逐渐确立了作为中国主流宗教的地位，与此相伴，则是倡导蔑视名教、主谈“玄远之学”的玄学日渐兴盛。
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在影响宗教传播的同时，瘟疫最终也助力改变了中国的历史走向。
梁朝太清元年（548年），东魏降将侯景又在梁朝内部发动叛变，并率兵进攻当时梁朝的首都建康城（南京），在侯景军队围攻建康城的几个月内，当时梁朝守城部队在吃光粮食后，又开始杀马匹、吃人肉，由于城中死人太多，有人在吃病尸后开始中毒，随后在建康城内出现了全城大瘟疫，以致后来侯景率兵攻入城内时，建康城内十几万人因为饥荒和瘟疫，死得仅剩三四千人，其余的也大多奄奄一息。由于担心尸体继续引发瘟疫，侯景就命人将尸体全部堆积起来焚烧，城内有生病未死的人，甚至也被投入火中。