运输费的计算公式如下：
运输费=营业运输费+自家运输费
其中：营业运输费=卡车货运费+铁路货运费+内海航运货运费+国内航空货运费+货运站收费
（2）保管费
保管费是将日本经济企划厅编制的《国民经济计算年报》中的国民资产、负债余额中原材料库存余额、产品库存余额及流通库存余额的合计数乘以日本资材管理学会调查所得的库存费用比例和原价率得出的。这项保管费不是狭义的保管费，它不仅包括仓储业者的保管费或企业自有仓库的保管费，还包括仓库、物流中心的库内作业费用和库存所发生的利息、损耗费用等。
保管费的计算公式如下：
保管费=（原材料库存余额+产品库存余额+流通库存余额）×原价率×库存费用比例
其中：库存费用比例=利率除外的库存费用比例+利率
（3）管理费
管理费无法用总体估计的方法求得，所以根据日本《国民经济计算年报》中的《国内各项经济活动生产要素所得分类统计》，将制造业和批发、零售业的产出总额，乘以日本物流系统协会根据行业分类调查得出的各行业物流管理费用比例的0.5%计算得出，即：