读罢这封奏疏，崇祯十分气恼。在他想来，练国事这明显是在为自己推卸责任，而根本没去想作为专负剿抚之责的五省总督陈奇瑜应该承担怎样的责任。于是，他当即召内阁辅臣及六部官员平台引对，以决定对几封奏疏的处理，并研究应对之策。
首辅大臣温体仁首先站出来道：
“山陕贼寇屡剿不灭，今更死灰复燃，臣以为，当非一朝一夕之患。诚如督师所言，山陕贼寇强悍之致，全是巡抚练国事纵容之结果，如此方成今日之大祸。目下，贼寇既已重炽，此纵容之徒必予以严惩，否则便不足以威震各路剿抚之师，祈皇上明察。”
作为首辅大臣的温体仁如此一说，似乎便为整个事件的处理定下了基调，但是他们又哪里知道，他这是在力保陈奇瑜啊！温体仁看的十分明白，农民军重又死灰复燃，作为专负剿抚之责的陈奇瑜也是难脱干系的，但是陈奇瑜给自己送过不少的银子，而且自从升任了五省总督后，陈奇瑜四处收掠的金银珍宝除自己的一份外便都会悉数秘密地送往京师温体仁的府上的。因此，在温体仁看来，以恩图报，此时不报又更待何时。是以，崇祯的话刚一说完，他便立即站出来说话，他看的明白，崇祯似乎也有要处罚练国事的意思，因此，他必须趁此首先为这事定下一个基调，这样，即使别的人有什么不同的意见，也就不好再开口了。