可是《明史》的结论却是：“验其尸，朽莫辨。”尸首没有办法辨认，怎么能确认这就是李自成呢？所以，“九宫山兵败被杀说”似乎并不那么可信。那么，历史和民间为什么都有这种说法呢？据推测，这或许是李自成与他的部下共同商量的计策，目的是让敌人误认为自己已经身亡，以争取时间东山再起。
隐居夹山寺说
第二种说法认为，李自成并没有死在九宫山，而是在战乱结束之后隐居在夹山寺。
清朝初年的时候，张琼伯在出任云南同知的途中路过夹山寺，与寺中方丈颇为谈得来。过了几年张琼伯重游此地，方丈已死，悼念之时，才知此方丈就是闯王李自成。
李自成雕像
乾隆初年，澧州知府前往夹山寺调查此事，在寺中发现一张名为“奉天玉和尚”的画像，画中的人物长得和李自成十分相似。1981年，夹山寺中确实发现了奉天玉和尚墓，墓葬的风格也与李自成家乡陕西米脂县墓葬的风格相似。
虽然有关李自成隐居的依据颇多，但是，李自成在夹山寺隐居的说法不能成为定论。奉天玉和尚墓的发现也只能证明夹山寺中有过一个叫作奉天玉和尚的人，并不能证明这个人就是闯王李自成。