之前，南梁右军司马胡景略等攻合肥，久久未能攻下，韦睿考察山川地形，夜里率众在淝水修筑堰坝，堰坝很快筑成，水位上涨，舟舰相继抵达城下。北魏在合肥东、西各修筑一座小城，韦睿先攻二城，北魏将领杨灵胤率众五万人突然杀到。众人担心不敌，请求上奏朝廷，增派援军，韦睿笑道：“贼军已经到了城下，才请求增兵，来得及吗！况且我们要求增兵，他也会增兵。用兵贵在出其不意，岂在人多呢！”于是进击杨灵胤，击破北魏军。
韦睿派军主王怀静筑城于河岸以把守堰坝，被北魏军攻陷，城中一千余人全军覆没。北魏军乘胜攻到堤下，兵势甚盛，诸将想要退还巢湖，或者退保三叉，韦睿怒道：“岂有此理！”下令把他的伞扇麾幢取来，竖在堤下，以示绝不离开。北魏人来凿堤，韦睿亲自上阵作战，北魏兵退却，韦睿就在堤坝上筑营，加强保护。韦睿修建主力战舰，高度与合肥城墙相等，将合肥四面包围，城中人皆哭，守将杜元伦登城督战，被弩箭射死。
五月十七日，合肥城崩溃，俘虏斩首一万余人，缴获牛马数以万计。
韦睿一向身体羸弱，从未骑马，每次作战，常坐在两人抬的轿子上监督勉励将士，勇气无敌；他白天接待宾客，半夜起床处理军事文书，灯火通明，直到天亮。他照顾自己的下属，常担心不够周到，所以投效军队的人争相到他的部队。所到之处，驻扎的营舍和围墙，都符合规范。